Według telewizji ABC News, 20 września 2004 roku samolot Boeing 707 z numerem pokładowym N88ZL wykonał bezpośredni lot z bazy Bagram w Afganistanie do Wilna. Na pokładzie samolotu miał się znajdować terrorysta Al-Kaidy.

W lipcu 2005 roku samolot czarterowy Gulfstream IV z numerem pokładowym N63MU odbył bezpośredni lot z Kabulu do Wilna. Kilku byłych funkcjonariuszy CIA potwierdziło fakt lotu i to, że został on wykorzystany do przetransportowania więźnia na Litwę.

ABC News podała, że więzienie na Litwie było ostatnią tego typu placówką CIA w Europie, po tym gdy pod koniec 2003 roku zamknięto więzienie w Polsce. Więzienie w Wilnie zostało zlikwidowane, gdy w listopadzie 2005 roku ujawniono informację o domniemanych więzieniach CIA w Polsce i w Rumunii.

Pod koniec sierpnia amerykańska stacja, powołując się na byłych funkcjonariuszy jednej z amerykańskich agencji wywiadowczych, podała, że do 2005 roku w okolicach Wilna przetrzymywano ośmiu terrorystów Al-Kaidy.

Zaprzecza temu MSZ Litwy, ówczesny prezydent Valdas Adamkus i ówczesny premier Algirdas Brazauskas.

We wtorek prezydent Litwy Dalia Grybauskaite podczas konferencji prasowej powiedziała, że ma "pośrednie podejrzenia", a "Zachód nie wątpi w to", że na Litwie były tajne więzienia CIA.

Prezydent zaznaczyła, że jeżeli podejrzenia się potwierdzą, Litwa będzie musiała wziąć za to odpowiedzialność i przeprosić.