Szczególną pamiątką związaną z osobą polskiego papieża jest barokowa chrzcielnica znajdująca się w kaplicy Świętej Rodziny. W tym miejscu 20 maja 1920 r. ochrzczony został mały Karol Wojtyła.

W 1992 r. wadowicka świątynia podniesiona została do godności bazyliki mniejszej.