Sąd Najwyższy uznał, że wojskowi nie mają prawa do sądzenia przetrzymywanych w więzieniu ludzi. Narusza to międzynarodowe porozumienia, w tym konwencję genewską.

W Guantanamo siedzi 460 więźniów, przeważnie muzułmanów aresztowanych w czasie wojny w Afganistanie. Wiekszość z nich została złapana podczas operacji antyterrorystycznych.

Obrońcy praw człowieka uważają bazę za przykład łamania praw człowieka przez administrację Busha.