Dokumenty na temat Mariusza Handzlika znajdują się w uzupełnianym katalogu Instytutu Pamięci Narodowej. O jego przeszłości jako pierwsze podało Radio RMF FM.
>>>Handzlik zaprzecza, że współpracował z SB
DZIENNIK dowiedział się, że . I dlatego najprawdopodobniej Mariusz Handzlik nie zostanie zwolniony. Poprzednik Handzlika Andrzej Krawczyk został wyrzucony z kancelarii, po tym jak ujawniono, że podpisał zobowiązanie do współpracy z SB. Ale on zataił tę informację przed Lechem Kaczyńskim.
Szef krakowskiego IPN Marek Lasota powiedział, że operacja "Wawel" nie była "krakowską sprawą". "Dotyczyła ona ludzi, w tym księży i osób związanych z archidiecezją krakowską, którzy mieszkali i działali w woj. bielskim" - mówi Lasota. W PRL podział kraju na województwa nie pokrywał się podziałem na diecezje. Część woj. bielskiego leżała więc w archidiecezji krakowskiej.
SB utraciła kontakt z Mariuszem Handzlikiem w grudniu 1987 roku. " (jednostronnie z winy TW) z powodu jego wyjazdu do Francji (…). Po nawiązaniu kontaktów z pracownikiem SB (...)" - wynika z dokumentów bezpieki.